近日,我校生命科學(xué)學(xué)院蛛形學(xué)研究團(tuán)隊(duì)的張俊霞副教授在國(guó)際著名進(jìn)化生物學(xué)刊物《Cladistics》上在線發(fā)表了題為“A novel probe set for the phylogenomics and evolution of RTA spiders”的研究論文。該研究中設(shè)計(jì)的UCE(超級(jí)保守元件)探針具有更多的基因位點(diǎn)和較高的捕獲效率,引領(lǐng)了重要的蜘蛛類群——RTA分支的系統(tǒng)學(xué)和進(jìn)化分類研究。
這是我校首次以第一作者第一單位署名在該雜志上發(fā)表論文。《Cladistics》由The Wiley Hennig Society主辦,屬于進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域的頂級(jí)刊物之一,在國(guó)際所有進(jìn)化生物學(xué)期刊中Cladistics排名第三。

蜘蛛為陸地上多樣性最豐富的捕食性類群之一,是織網(wǎng)、性選擇和適應(yīng)性進(jìn)化研究的重要模型。RTA(脛節(jié)外側(cè)突)分支作為蜘蛛中的主要類群之一,其物種多樣性占蜘蛛的一半以上,是深入探究蜘蛛進(jìn)化和多樣性的關(guān)鍵。為了更好地解析RTA分支復(fù)雜的系統(tǒng)演化關(guān)系,該項(xiàng)研究對(duì)15種RTA蜘蛛進(jìn)行了全基因組測(cè)序,并利用8個(gè)參考基因組專門針對(duì)這一類群設(shè)計(jì)了UCE探針(RTA探針)用于系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究。對(duì)所設(shè)計(jì)的探針進(jìn)行了電腦模擬以及實(shí)驗(yàn)室捕獲雙項(xiàng)測(cè)試,結(jié)果表明RTA探針的捕獲效率最高可達(dá)82%,其捕獲的位點(diǎn)數(shù)(~2597個(gè)UCEs)是蜘蛛目探針的2.5倍左右。利用RTA探針從57個(gè)物種獲得UCE數(shù)據(jù)并構(gòu)建蜘蛛目和RTA分支主要譜系的系統(tǒng)演化關(guān)系,結(jié)果與其它系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究結(jié)果基本一致。因此,該套探針的發(fā)表將進(jìn)一步推動(dòng)重建RTA分支以及蜘蛛目生命之樹的研究進(jìn)程。

張俊霞博士2012年博士畢業(yè)于加拿大不列顛哥倫比亞大學(xué),2013–2018年在美國(guó)加州大學(xué)河濱分校從事博士后研究和工作,一直從事蛛形動(dòng)物和部分昆蟲的系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)和生物地理學(xué)研究。2019年引進(jìn)我校,目前是生命科學(xué)學(xué)院副教授。目前已在Cladistics、Systematic Entomology、Molecular Phylogenetics and Evolution等國(guó)際知名刊物上發(fā)表研究論文60篇,參編專著4部;發(fā)表蜘蛛目20新屬,200余新種。主持或作為項(xiàng)目組主要成員參與6項(xiàng)國(guó)家級(jí)(中國(guó)、加拿大、美國(guó))自然科學(xué)基金項(xiàng)目。日前張俊霞副教授剛剛獲得2022年度“燕趙友誼獎(jiǎng)”——河北省人民政府授予外國(guó)專家的最高榮譽(yù)獎(jiǎng)項(xiàng)。
該研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(32070422)、河北大學(xué)高層次人才科研啟動(dòng)項(xiàng)目(521000981324)和河北大學(xué)生命科學(xué)與綠色發(fā)展研究院的資助。
論文鏈接:https://doi:10.1111/cla.12523
(生命科學(xué)學(xué)院、科學(xué)技術(shù)處供稿)