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生命科學(xué)學(xué)院2020級(jí)鳳凰班本科生在國(guó)際期刊Nucleic Acids Research發(fā)表高水平文章

發(fā)布時(shí)間:2023-11-03 15:51

2023年10月,河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院2020級(jí)生命科學(xué)鳳凰班本科生程美琪,以共同第一作者身份在《Nucleic Acids Research》(最新影響因子為14.9)發(fā)表論文“BATMAN-TCM 2.0: an enhanced integrative database for known and predicted linkages between traditional Chinese medicine ingredients and target proteins”,成為繼2018級(jí)孔祥任、2019級(jí)瞿英杰之后,第三位在國(guó)際期刊發(fā)表高水平論文的生命科學(xué)鳳凰班本科生,鳳凰班本科生梅志君、李向東、劉鵬為該論文的共同作者。該項(xiàng)工作由河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院同國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(北京)聯(lián)合開(kāi)展,生命科學(xué)學(xué)院是第三署名單位。這是生命科學(xué)學(xué)院與國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心科教結(jié)合、協(xié)同育人的又一重要成果。

BATMAN-TCM是國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心研發(fā)的一個(gè)用于研究中藥成分與靶標(biāo)蛋白之間相互作用的分析體系(http://bionet.ncpsb.org.cn/batman-tcm/),BATMAN-TCM 1.0在發(fā)表后受到了學(xué)術(shù)界的廣泛關(guān)注,目前已有超過(guò)640次論文引用和40萬(wàn)次訪問(wèn)。BATMAN-TCM 2.0新增了通過(guò)組學(xué)數(shù)據(jù)篩選潛在中藥的功能,并對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中已知和預(yù)測(cè)的中藥成分與靶標(biāo)蛋白之間的相互作用數(shù)據(jù)進(jìn)行擴(kuò)增。BATMAN-TCM 2.0數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)中藥藥物研發(fā)以及尋找治療復(fù)雜疾病的潛在藥物都具有十分重要的意義。

生命科學(xué)學(xué)院高度重視生物學(xué)拔尖創(chuàng)新人才的培養(yǎng),于2015年與國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心(“鳳凰中心”)簽訂了《聯(lián)合共建“生命科學(xué)鳳凰班”戰(zhàn)略合作協(xié)議》,共同培養(yǎng)高水平的生物信息學(xué)人才。鳳凰中心作為我國(guó)生命科學(xué)領(lǐng)域的首個(gè)國(guó)家重大科學(xué)基礎(chǔ)設(shè)施,部署了國(guó)際上最大規(guī)模的高端蛋白質(zhì)組測(cè)序平臺(tái)以及以“天河2號(hào)”架構(gòu)超級(jí)計(jì)算機(jī)為代表的頂尖設(shè)備,為我校本科生培養(yǎng)提供了得天獨(dú)厚的學(xué)習(xí)條件。多年來(lái),生命科學(xué)鳳凰班已畢業(yè)5屆89名本科生,在SCI期刊發(fā)表12篇研究論文。

隨著科教結(jié)合協(xié)同育人的深入開(kāi)展,河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院與鳳凰中心會(huì)更加緊密合作,探索育人新模式,攜手并進(jìn),共創(chuàng)輝煌!

附:鳳凰班三位同學(xué)的基本情況

程美琪,河北大學(xué)2020級(jí)鳳凰班本科生,已免試推薦軍事科學(xué)院2024級(jí)生物信息專業(yè)碩士研究生。2023年10月(大四上學(xué)期)以并列第一作者在《Nucleic Acids Research》(當(dāng)年影響因子14.9)發(fā)表論文“BATMAN-TCM 2.0: an enhanced integrative database for known and predicted linkages between traditional Chinese medicine ingredients and target proteins”。

瞿英杰,2019級(jí)鳳凰班本科生,現(xiàn)為軍事科學(xué)院2023級(jí)生物信息專業(yè)在讀五年制直博研究生。2022年8月(大三下學(xué)期)以并列第一作者在《Cells》(當(dāng)年影響因子7.6)發(fā)表論文“Integration of Human Protein Sequence and Protein-Protein Interaction Data by Graph Autoencoder to Identify Novel Protein-Abnormal Phenotype Association”,并被所發(fā)表期刊評(píng)為當(dāng)期最佳論文(“Editor’s Choice”)。

孔祥任,2018級(jí)鳳凰班本科生,現(xiàn)為軍事科學(xué)院生物信息專業(yè)2022級(jí)在讀碩士研究生。2021年10月(大四上學(xué)期)以并列第一作者在《Nucleic Acids Research》(當(dāng)年影響因子19.1)發(fā)表論文“UbiBrowser 2.0: a comprehensive resource for proteome-wide known and predicted ubiquitin ligase/deubiquitinase–substrate interactions in eukaryotic species”。

(生命科學(xué)學(xué)院 供稿)

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